2016 yılı yaz kararnamesi ile Nevşehir E Tipi Kapalı Ceza İnfaz Kurumu Müdürü olarak atanarak 14 Ekim 2016 tarihinde göreve başlayan Kağan Gençer, 2021 yılı yaz kararnamesi ile İzmir Buca Yüksek Güvenlikli Kapalı Ceza İnfaz Kurumu Müdürü olarak atandı.
Gençer, 27 Temmuz itibariyle Nevşehir E Tipi Kapalı Ceza İnfaz Kurumundaki görevinden ayrıldı.
