NEVÜ’ye bağlı Fen Bilimleri Enstitüsü bünyesinde ‘Çevre Mühendisliği Anabilim Dalı Doktora Programı’nın açılmasına yönelik talep Yüksek Öğretim Kurumu (YÖK) tarafından uygun görüldü. NEVÜ tarafından mühendislik alanında açılan ilk doktora programı olma özelliği de taşıyan Çevre Mühendisliği Anabilim Dalı Doktora Programı kapsamında, araştırma ve geliştirme çalışmaları ile Nevşehir’in ve Kapadokya bölgesinin çevresel sorunlarına çözümler getirilerek, çevre kirliliğine karşı teknolojiler geliştirilecek.