Çardak köyünün simge yapısının, milattan sonra 5.yüzyılda bölgede bulunan Bizanslılar tarafından kilise olarak inşa edildiği biliniyor.
Yapı daha sonra bölgenin Karamanoğulları Beyliği hakimiyetine girmesiyle birlikte Ürgüp Uçbeyi tarafından camiye çevriliyor.
Ayrıca Osmanlı döneminde de bölgede azınlık konumuna düşen Hıristiyanların maddi imkanlarının yetersiz olması nedeniyle, Ürgüp Kadısı tarafından caminin bir bölümünün kilise olarak ayrılmasının kararlaştırıldığı ve 200 yıldır bu şekilde cami-kilise olarak mevcut şekliyle kullanıldığı biliniyor.
Selçuklu dönemine ait olan cami zaman içerisinde kullanımlardan dolayı orijinalliğini yitirirken, caminin iç mekanı kubbe ve duvarlarından çok fazla nem alması kullanımda sıkıntılar yaşanmasına neden oluyor.
Selçuklu dönemine ait tarihi caminin yapıldığı dönemin tarihi izlerini yeniden yaşatmak amacıyla restorasyon çalışmalarına başlandı.
Ayrıca restorasyon çalışmalarının yanı sıra caminin mimari yapısına uygun avlu çalışmaları da yapılıyor.
